ikinci mustafa'nın ıslahatları arasında şunlar yer alır; askeri alanda yapılan ıslahatları vardır. bunlar sekbanı cedit kurulmuştur. vakayi hayriye olayı yaşanmış ve üzerin yeniçeri ocağı kapatılarak, yerin asakiri mansuriyei muhammedi ocağı kurulmuştur. mızıkai hümayün kurulmuştur. eğitim alanında da istanbul'da ilk okul artık zorunla hale getirilmiştir. köy ve mahalle muhtarlıkları kurulmuştur. polis ve posta teşkilatı yeni 2. mustafa zamanında kurulmuştur. devlet memurlarına maaş bağlanmıştır. ilk resmi gazete olan takvimi vekai gazetesi kurulmuştur. ayrıca ilk olarak bu dönemde ülkeye giriş ve çıkışlarda pasaport uygulaması başlamıştır.
sürat topcuları adı verilen ocak kuruldu.
deniz mühendishanesi açıldı.
hendesehanesi açıldı. denizcilik ve topculuk dersleri verilmeye başladı.