işlerinin düzene girdiği bir sırada vereme yakalanan berkyaruk, bir sedye içinde bağdat istikametinde yola çıkarıldı. terken hatun’u yendiği berûcird’e geldiğinde durumu iyice ağırlaştı. hayatından umut kesilince emirlerini yanına çağırarak beş yaşındaki oğlu melikşah’ı veliaht, emir ayaz’ı da ona atabey tayin etti. emirlerinden melikşah’a itaat etmeleri ve onu düşmanlarına karşı korumalarını istedi. sultan’ın talebini kabul eden emirler melikşah’ı desteklemek hususunda canlarını ve mallarını esirgemeyeceklerine dair yemin ettiler. bunun üzerine oğlu melikşah’ı ve emirlerini bağdat’a gönderdi. kendisi de isfahan’a dönmek üzere burada kaldı. fakat kafile berûcird’den henüz uzaklaşmıştı ki, berkyaruk, 22 aralık 1104 tarihinde yirmi beş yaşında vefat etti.