hücre zarlarında proteinler zar yüzeyinde bulunurlar hücre zarının bir yüzeyinde yoğun olarak bulunurlar başka yüzeyinde doğru olarak diğerine uzanan proteinler vardır.
bilindiği üzere sitoplazmik zarın protein içeriği oldukça yüksektir.bu nedenle zar proteinleri genellikle zarı kapsayan bölgelerdeki hidrofobik yüzeylere ve sitoplazma ve ortam ile temas eden bölgelerdeki hidrofilik yüzeylere sahiptir.bunun dışında sitoplazmik zarın dış yüzeyi ortamla karşı karşıyadır ve gram negatif bakterilerde substratları bağlayan veya hücre içine taşımak için daha uzun molekülleri işleyen çeşitli proteinler ile etkileşime girmektedir.sitoplazmik zarın iç yüzeyi ise sitoplazma ile temas etmekte ve bu ortamdaki proteinler ile ve diğer moleküllerle etkileşime girmektedir.birçok zar proteini de zar içerisine gömülü halde bulunur.bunlara integral zar proteinleri adı verilmektedir.diğer proteinler zara ve dış zar bölgesi'nin içine veya hücre dışına bir parça tutulmuş olanlardır.ayrıca çevresel proteinler olarak adlandırılan diğer proteinler zara gömülü değildir.ancak yine de zar yüzeyleri ile bağlantılı olarak kalır.bu çevresel zar proteinlerinin bazıları lipoproteinlerdir ve zar içerisinde proteine bağlanan bir lipit kuyruğu içeren moleküllerdir.çevresel zar proteinleri genellikle enerji üretimi ve taşınım gibi önemli hücresel süreçlerde integral zar proteinleri ile etkileşir.zar proteinleri bazı süreçlerde zarda yarı sıvı bir çevrede bitişik kalarak birbirleriyle etkileşim halinde grup olarak bulunmaktadır.